Otprilike od kraja 19. veka, naučnici su počeli da gomilaju znanje o razlikama između pro- i eukariotskih ćelija, i tako postepeno izolovali zasebno carstvo mikroorganizama, ujedinjeno nedostatkom ćelijske diferencijacije, - Protista. Međutim, šta su bakterije, u to vreme su morali samo da prouče: tek u 20. veku. ovo znanje je sistematizovano.
Bakterije se nalaze u svim sredinama u kojima se mogu akumulirati organske materije. Podnose visoke i niske temperature, slanost i kiselost. Dakle, carstvo bakterija ne živi samo u okolišu, gdje razgrađuju organsku tvar za svoju životnu aktivnost, već gusto naseljava mnoge sluznice životinja i ljudi, pomažući u varenju hrane i natječući se s patogenim mikroorganizmima. Njihova uloga u metabolizmu dušika je posebno velika, jer su samo cijanobakterije sposobne prerađivati atmosferski dušik. Međutim, neke bakterije su uzročnici bolesti: kuge, anaerobnih i crijevnih infekcija, sifilisa, kolere i antraksa.
Morfologija
Ultrastruktura bakterija može se vidjeti samo elektronskim mikroskopom, ali šta su bakterije i kako izgledaju spolja može se vidjeti i imerzionom mikroskopijom koristeći posebne tehnike bojenja. Veličine ovih mikroorganizama variraju od 0,1 do 10 mikrona, ali morfologija bakterija nam omogućava da ih podijelimo u 3 glavne grupe: sferne - koke (mono-, diplo-, tetra-, streptokoke i sarcine), štapićaste - bacili (mono-, diplo-, strepto-) i uvijene - vibrije, spirile i spirohete. U laboratorijskim uslovima, radi određivanja vrste i enzimskih svojstava, uzgajaju se na jednostavnim ili posebnim hranljivim podlogama formiranjem kolonija, au različitim podlogama imaju različit obrazac rasta.
Zgrada
Općenito, šta su bakterije određuje njihova ultrastruktura. Napolju, bakterije su zaštićene ćelijskim zidom koji se sastoji od slojeva peptidoglikana, lipida i teihoične kiseline. Koncentracija prvih određuje sposobnost bakterija da se boje prema Gram metodi u razmazu, prema kojoj se dijele na Gr+ i Gr-. Neki od njih imaju dodatnu zaštitnu strukturu - kapsulu koja sadrži K-antigen i sprječava njihovu fagocitozu unutar makroorganizma, djelovanje toksičnih i mehaničkih faktora. Da biste saznali više o tome što su bakterije, morate proučiti njihovu unutarćelijsku strukturu: bakterije su ispunjene citoplazmom, u kojoj su otopljene druge organele (ribozomi, kromatofore) i nutrijenti (lipidi, šećeri). Oni su kaoi svi prokarioti nemaju formalizirano jezgro, a sve genetske informacije pohranjene su u dvolančanom molekulu nukleinske kiseline smještenom u nukleoidnoj zoni i fiksiranom za membranu u jednoj tački. Izvan njega, genetske informacije sadržane su u plazmidima koji mogu odrediti razvoj patogenih svojstava i faktora. Za kretanje koriste flagele i spirilu, fiksirane u ćeliji bazalnim tijelom, a njihova reprodukcija se odvija podjelom na dva.
